学术查重后留下记录的主要原因是为了维护学术诚信和学术规范。在学术界，抄袭是一种严重的学术不端行为，查重工具可以帮助学术界发现抄袭现象，保护学术成果的原创性和独立性。因此，学术查重后留下记录是为了建立起一个公正、透明的学术环境，促进学术交流与发展。

另外，学术查重后留下记录还可以帮助学者进行学术自查和自律。通过查重结果的记录，学者可以及时发现自己的不当引用或抄袭行为，及时进行修改和整改，避免因为疏忽而触犯学术规范。这种自查自律的机制有助于提高学者的学术水平和独立思考能力，促进学术研究的健康发展。